MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 2754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	CAA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676128
2	NC_014254	AAAC	2	8	172	179	75 %	0 %	0 %	25 %	298676128
3	NC_014254	TGG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298676128
4	NC_014254	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676128
5	NC_014254	ATT	2	6	575	580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676128
6	NC_014254	TGA	2	6	589	594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676128
7	NC_014254	TAG	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676128
8	NC_014254	TAT	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676128
9	NC_014254	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676128
10	NC_014254	TCT	2	6	740	745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676128
11	NC_014254	ATG	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676128
12	NC_014254	ATA	2	6	846	851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676128
13	NC_014254	AGA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676128
14	NC_014254	TAT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676128
15	NC_014254	A	8	8	1094	1101	100 %	0 %	0 %	0 %	298676128
16	NC_014254	AGT	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676128
17	NC_014254	TGAT	2	8	1348	1355	25 %	50 %	25 %	0 %	298676128
18	NC_014254	GAA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676129
19	NC_014254	GAA	2	6	3164	3169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676129
20	NC_014254	GAA	2	6	3191	3196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676129
21	NC_014254	CAG	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676129
22	NC_014254	ATAC	2	8	3380	3387	50 %	25 %	0 %	25 %	298676129
23	NC_014254	GTT	2	6	3407	3412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676129
24	NC_014254	ATC	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676129
25	NC_014254	GA	3	6	3455	3460	50 %	0 %	50 %	0 %	298676129
26	NC_014254	TCAAGA	2	12	3490	3501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298676129
27	NC_014254	TTCA	2	8	3525	3532	25 %	50 %	0 %	25 %	298676129
28	NC_014254	AAG	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676129
29	NC_014254	TACA	2	8	3649	3656	50 %	25 %	0 %	25 %	298676129
30	NC_014254	AGA	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676129
31	NC_014254	CAACAG	2	12	3700	3711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298676129
32	NC_014254	TC	3	6	3731	3736	0 %	50 %	0 %	50 %	298676129
33	NC_014254	TGT	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676129
34	NC_014254	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676129
35	NC_014254	CTA	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676129
36	NC_014254	AG	3	6	3811	3816	50 %	0 %	50 %	0 %	298676129
37	NC_014254	TAC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676129
38	NC_014254	ATG	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
39	NC_014254	GTA	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
40	NC_014254	TGA	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
41	NC_014254	TG	3	6	4307	4312	0 %	50 %	50 %	0 %	298676130
42	NC_014254	AAT	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
43	NC_014254	ATG	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
44	NC_014254	GAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676130
45	NC_014254	AT	3	6	4447	4452	50 %	50 %	0 %	0 %	298676130
46	NC_014254	ACT	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
47	NC_014254	GAT	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
48	NC_014254	GAT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
49	NC_014254	GAA	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676130
50	NC_014254	GTG	2	6	4803	4808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298676130
51	NC_014254	CAA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676130
52	NC_014254	TTA	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
53	NC_014254	TAT	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
54	NC_014254	TTTAC	2	10	4916	4925	20 %	60 %	0 %	20 %	298676130
55	NC_014254	ATA	2	6	4941	4946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
56	NC_014254	TAC	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
57	NC_014254	GAATGG	2	12	5095	5106	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676130
58	NC_014254	GAT	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
59	NC_014254	ATA	2	6	5141	5146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
60	NC_014254	ACA	3	9	5189	5197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676130
61	NC_014254	TTA	2	6	5209	5214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
62	NC_014254	TAT	2	6	5240	5245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
63	NC_014254	TCA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
64	NC_014254	TTC	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676130
65	NC_014254	ATA	2	6	5355	5360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
66	NC_014254	ATG	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
67	NC_014254	TAA	2	6	5512	5517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
68	NC_014254	TAC	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
69	NC_014254	CTC	2	6	5601	5606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298676130
70	NC_014254	AAT	2	6	5708	5713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
71	NC_014254	ACCA	2	8	5736	5743	50 %	0 %	0 %	50 %	298676130
72	NC_014254	GGA	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298676130
73	NC_014254	TAT	2	6	5921	5926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
74	NC_014254	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
75	NC_014254	TAC	2	6	6013	6018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
76	NC_014254	AGT	2	6	6028	6033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
77	NC_014254	CAA	2	6	6074	6079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676130
78	NC_014254	ATGG	2	8	6116	6123	25 %	25 %	50 %	0 %	298676130
79	NC_014254	GAT	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
80	NC_014254	GTA	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676130
81	NC_014254	ACA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676130
82	NC_014254	TAA	2	6	6214	6219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
83	NC_014254	TAT	2	6	6257	6262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
84	NC_014254	TTTAC	2	10	6290	6299	20 %	60 %	0 %	20 %	298676130
85	NC_014254	CAGC	2	8	6413	6420	25 %	0 %	25 %	50 %	298676130
86	NC_014254	ATGGAG	2	12	6453	6464	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298676130
87	NC_014254	TAC	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
88	NC_014254	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
89	NC_014254	ATA	2	6	6666	6671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
90	NC_014254	ACT	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
91	NC_014254	AAT	2	6	6722	6727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
92	NC_014254	CCAG	2	8	6751	6758	25 %	0 %	25 %	50 %	298676130
93	NC_014254	TAA	2	6	6790	6795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
94	NC_014254	ACA	2	6	6884	6889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676130
95	NC_014254	ATA	2	6	6993	6998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
96	NC_014254	CAG	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676130
97	NC_014254	TAC	2	6	7030	7035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
98	NC_014254	GA	3	6	7056	7061	50 %	0 %	50 %	0 %	298676130
99	NC_014254	ACCA	2	8	7089	7096	50 %	0 %	0 %	50 %	298676130
100	NC_014254	TAA	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
101	NC_014254	ACA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676130
102	NC_014254	TAT	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676130
103	NC_014254	CAG	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676130
104	NC_014254	TAC	2	6	7369	7374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676130
105	NC_014254	GA	3	6	7396	7401	50 %	0 %	50 %	0 %	298676130
106	NC_014254	CCAG	2	8	7430	7437	25 %	0 %	25 %	50 %	298676130
107	NC_014254	TAA	2	6	7469	7474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676130
108	NC_014254	ACA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676131
109	NC_014254	TAT	2	6	7614	7619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676131
110	NC_014254	CAG	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676131
111	NC_014254	TAC	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676131
112	NC_014254	GA	3	6	7735	7740	50 %	0 %	50 %	0 %	298676131
113	NC_014254	CCAG	2	8	7769	7776	25 %	0 %	25 %	50 %	298676131
114	NC_014254	TAA	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676131
115	NC_014254	ACA	2	6	7902	7907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676131
116	NC_014254	TAT	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676131
117	NC_014254	CAG	2	6	8036	8041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676131
118	NC_014254	TAC	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676131
119	NC_014254	TTTG	2	8	8142	8149	0 %	75 %	25 %	0 %	298676131
120	NC_014254	ACA	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676131
121	NC_014254	TA	3	6	8305	8310	50 %	50 %	0 %	0 %	298676131
122	NC_014254	GCA	2	6	8322	8327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298676131
123	NC_014254	TGA	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676131
124	NC_014254	GTAT	2	8	8461	8468	25 %	50 %	25 %	0 %	298676131
125	NC_014254	CAGC	2	8	8469	8476	25 %	0 %	25 %	50 %	298676131
126	NC_014254	TA	3	6	8566	8571	50 %	50 %	0 %	0 %	298676131
127	NC_014254	TAT	2	6	8649	8654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676131
128	NC_014254	ATA	2	6	8734	8739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298676131
129	NC_014254	GTT	2	6	8877	8882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676131
130	NC_014254	AACA	2	8	8918	8925	75 %	0 %	0 %	25 %	298676131
131	NC_014254	ACAG	2	8	8958	8965	50 %	0 %	25 %	25 %	298676131
132	NC_014254	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676131
133	NC_014254	ACAGT	2	10	9053	9062	40 %	20 %	20 %	20 %	298676131
134	NC_014254	ATT	2	6	9124	9129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298676131
135	NC_014254	TGT	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676131
136	NC_014254	TTG	2	6	9412	9417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676132
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138	NC_014254	T	7	7	9468	9474	0 %	100 %	0 %	0 %	298676132
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141	NC_014254	GTT	2	6	9687	9692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676132
142	NC_014254	CTAA	2	8	9712	9719	50 %	25 %	0 %	25 %	298676132
143	NC_014254	TGA	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298676132
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148	NC_014254	TA	3	6	10088	10093	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
149	NC_014254	AGA	2	6	10125	10130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298676132
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156	NC_014254	ATGTC	2	10	10386	10395	20 %	40 %	20 %	20 %	298676132
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166	NC_014254	A	6	6	10901	10906	100 %	0 %	0 %	0 %	298676132
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168	NC_014254	A	8	8	10937	10944	100 %	0 %	0 %	0 %	298676132
169	NC_014254	TA	3	6	10954	10959	50 %	50 %	0 %	0 %	298676132
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255	NC_014254	GACT	2	8	17113	17120	25 %	25 %	25 %	25 %	298676135
256	NC_014254	CTTT	2	8	17180	17187	0 %	75 %	0 %	25 %	298676135
257	NC_014254	T	6	6	17185	17190	0 %	100 %	0 %	0 %	298676135
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263	NC_014254	CCAT	2	8	17854	17861	25 %	25 %	0 %	50 %	298676135
264	NC_014254	CTC	2	6	17892	17897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298676135
265	NC_014254	ACA	2	6	17935	17940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298676135
266	NC_014254	TCT	2	6	18201	18206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676136
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268	NC_014254	TAC	2	6	18267	18272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676136
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271	NC_014254	TTC	3	9	18376	18384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298676136
272	NC_014254	CAT	2	6	18495	18500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676136
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391	NC_014254	TCA	2	6	24592	24597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298676137
392	NC_014254	TCTG	2	8	24622	24629	0 %	50 %	25 %	25 %	298676137
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399	NC_014254	A	6	6	24893	24898	100 %	0 %	0 %	0 %	298676137
400	NC_014254	A	7	7	24901	24907	100 %	0 %	0 %	0 %	298676137
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488	NC_014254	A	6	6	29497	29502	100 %	0 %	0 %	0 %	298676141
489	NC_014254	T	7	7	29586	29592	0 %	100 %	0 %	0 %	298676141
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499	NC_014254	TTTC	2	8	30146	30153	0 %	75 %	0 %	25 %	298676141
500	NC_014254	GTT	2	6	30209	30214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298676141

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